同案犯指认本人不承认怎么办

以实际证据为准。

在案件调查中，最重要的就是重证据轻口供，这是为了防止有替人顶罪，或者为了减轻追责故意污蔑他人的行为。

如果没有证据表明指认的那个人有犯罪行为，那不管对方承不承认，都不能对其定罪，反之如果有证据证明对方有犯罪行为，就算不承认，也是可以进行逮捕处理